Tutkimusinfrastruktuuri

Histologian palvelut

Tampereen yliopisto

Lääketieteen ja terveysteknologian tiedekunta

Kaupin kampus

Arvo Ylpön katu 34, 33520 Tampere

Palveluhaku

Tutkimushaku

Tilat ovat esteettömät

MET core-tilat ja palvelut

Johdanto

Histologian laitos (HF) toivottaa kaikki MET:n tutkijat tervetulleiksi tekemään kudoshistologista työtään nykyaikaisten laitteiden ja mikroskooppien avulla. Teknikot auttavat sinua teknisissä kysymyksissä ja voivat tehdä kudosten käsittelyn, värjäyksen ja analysoinnin aina kun se on mahdollista. HF kannustaa käyttämään digitaalista mikroskooppia ja koko objektilasin skannausta, jotta voit tuottaa aineistoa kvantitatiivisia tieteellisiä analyysejä varten.

Histologian laitos (HF) sijaitsee Arvo-rakennuksen 3. kerroksessa (E-siipi, laboratoriot ja mikroskooppihuoneet). Henkilökuntamme antaman koulutuksen jälkeen käyttäjät voivat itse tehdä tiettyjä histologian laboratorion perustehtäviä. Näihin kuuluvat mikrotomien, kryomikrotomien, kudosprosessorien, mikroskooppien käyttö ja parafiiniblokkien valu. Erityislaitteita käyttää vain HF:n henkilökunta, kysy lisää palveluista!

Varausjärjestelmä

Kaikki käyttäjien itse käyttämät laitteet on varattava Agendon kautta. Huomaa, että histocoren henkilökunnalla on etusija laitteiden käytössä.

KIITOKSET

Kaikkien Histologian (HF) palveluiden käyttäjien tulee mainita se julkaisuissaan:

“Kirjoittajat kiittävät palveluistaan Tampereen Histologian (HF) palveluita".

MET core-tilat ja palvelut

Kudosteknologiat:

Kudoksen preparointi

HF:llä on kolme kudosprosessoria kiinteiden kudosnäytteiden parafiinilblokkien valmistamiseen. Sekä formaliini- että Paxgene-fiksattuja kudoksia voidaan valmistaa.

HF:llä on kaksi liukuleikkaavaa mikrotomia parafiiniblokkien leikkaamiseen (leikkeen paksuutta voidaan säätää 2-6 mikrometriin). Jääleikkeiden leikkaamiseen on saatavilla Leica- ja Slee MEV+ -kryomikrotomit.

Viljeltyjen solujen preparointi

Käyttäjät valmistavat itse kudospreparaatit. Soluviljelmät, jotka ovat suspensiossa, voidaan valmistaa leikattaviksi kudosblokeiksi käyttäen trombiinikoagulaatiotekniikkaa. Vaihtoehtoisesti voidaan käyttää Sakura Cytocentrifugea soluobjektilasien valmistamiseen IHC- ja IF-värjäystä varten.

Kudosten värjäys

HF:llä on yksi Kedee-värjäyslaite automaattiseen hematoksyliini-eosiini-värjäykseen ja muihin rutiinivärjäyksiin. Peitinlasi voidaan asettaa automaattisesti käyttäen DAKO-peitinlasinlaittajaa.

Immunohistokemia

HF:llä on yksi Ventana BenchMark - ja kaksi LabVision -automaattivärjäyslaitetta automaattiseen immunohistokemiaan. Antigeenin saaminen esille voidaan tehdä PT-moduulilla, Retriever 2100:lla tai Biocarella tai mikroaaltouunilla käyttäen pH6- tai pH9-puskureita.

Immunofluoresenssi

Immunofluoresenssivärjäys voidaan tehdä automaattisesti käyttäen LabVision Autostaineria tai manuaalisesti käyttäen erilaisia värjäystelineitä. Näistä JL-Stainer sopii hyvin 1-10 IF-lasin värjäykseen.I

Mikroarrayt kudoksille (TMA =Tissue microarray)

Kudosmikroarrayden parafiiniblokkeja voidaan valmistaa käyttäen 3D Histech TMA Master -järjestelmää. Järjestelmä mahdollistaa 0,6-2 mm halkaisijaltaan olevien kudoslieriöiden stanssauksen ja kokoamisen 1-2 TMA-blokkiin. TMA-blokkien leikkaus ja värjäys tehdään samoilla menetelmillä kuin perinteiset kudosnäytteet.

Valomikroskoopit

HF:llä on useita Olympus BX- ja Leica DM -mikroskooppeja, joita käytetään objektilasien tarkasteluun. Osa näistä on varustettu digitaalisilla kameroilla kuvausta varten.

Fluoresenssimikroskooppi

HF:llä on Zeiss Axioplan -mikroskooppi monivärisen fluoresenssikuvantamisen ja kuvien tallennuksen mahdollistamiseksi. Mikroskooppi on varustettu ApoTome-laitteella, joka mahdollistaa strukturoidun valaistuksen avulla terävien konfokaalityyppisten kuvien tuottamisen eri tasoilla paksustakin kudoksesta kaikilla aallonpituuksilla. Mikroskooppia käytetään AxioVision-ohjelmiston avulla.

Laser capture -mikrodissektio

Veritas Arcturus Laser Capture -järjestelmää voidaan käyttää solusaarekkeiden tai yksittäisten solujen eristämiseen soluviljelmistä ja jäädytetyistä kudosleikkeistä. Mikrodissektoitu materiaali voidaan tutkia molekyylibiologian menetelmillä (esim. PCR-pohjaisilla menetelmillä).

GeoMx-järjestelmä

Virtuaalimikroskopia

Virtuaalimikroskopia tarkoittaa mikroskoopisten näytelasien digitoitujen versioiden taltiointia ja käsittelyä, jotka puolestaan tunnetaan yleisesti "virtuaalisina näytelaseina" tai "koko näytelasin kuvina (WSIs =whole-slide images)". Virtuaaliset näytelasit ovat koostekuvia, jotka koostuvat tuhansista korkearesoluutioisista digitaalisista mikrograafeista.

Virtuaalisten näytelasien skannausjärjestelmät

HF:llä on käytössä kaksi virtuaalisten näytelasien skanneria (Hamamatsu ja Olympus), jotka mahdollistavat usean mikroskooppilasin skannaamisen yhdessä erässä. Vaihtoehtoisesti myös 2×3 tuuman makronäytelasien skannaaminen on mahdollista. Käyttäjä voi valita skannaustarkkuuden 0,31 um/pikseli (10X objektiivilla) ja 0,16 um/pikseli (20X objektiivilla). Skannaus öljyimmersion objektiivien kanssa on myös mahdollista.

Molemmat skannerit mahdollistavat skannauksen epifluoresenssivalaistuksella käyttäen sinistä, vihreää ja punaista emissiospektriä. Skannauksen tulosteena käytetään jpeg2000-kuvamuotoa.

Virtuaalimikroskopian skannausjärjestelmä kuoppalevyille

Kuoppalevyjä voidaan skannata järjestelmällä, joka on asennettu käänteismikroskoopin (Olympus IX71) tai EVOS FL Auto -laitteen yhteyteen. Nämä järjestelmät mahdollistavat solujen skannaamisen Petri-maljoilta ja 24-96 kuoppalevyiltä. Perusvalaistusjärjestelmänä käytetään faasikontrastia, mutta fluoresoiva valaistus (moottoroidulla suodattimen vaihtajalla) on myös mahdollista.