Opinto-opas 2009-2010 |
|||||
| Perus | Pori | KV | Jatko | Avoin | |
|
|
|
|||||||||||||||||
Laskennallinen systeemibiologia (Ti), 30 op |
Syventävät opinnot
Olli Yli-Harja, Reija Autio
- Opintokokonaisuuden tavoitteena on tarjota opiskelijalle biologisen datan, signaalien ja kuvien analyysin sekä mallinnuksen teoreettiset perustiedot ja käytännön taidot yksinkertaisten systeemibiologisten ongelmien ratkaisemiseen.
| Tutkinto |
| Signaalinkäsittelyn ja tietoliikennetekniikan koulutusohjelma - Diplomi-insinöörin tutkinto |
| Tietotekniikan koulutusohjelma - Diplomi-insinöörin tutkinto |
| Opintokokonaisuus | Opintopisteet | P/S | Lisätiedot |
| Lääketieteellinen tekniikka | 25 op | Pakollinen | Esitietoina tulee olla myös suoritettuna kurssit SGN-1200 Signaalinkäsittelyn menetelmät, SGN-2500 Johdatus hahmontunnistukseen ja SGN-3010 Digitaalinen kuvankäsittely I. |
| Signaalinkäsittely ja multimedia | 25 op | Pakollinen | Esitiedoiksi käy jompikumpi luettelon aineopintokokonaisuuksista. |
Signaalinkäsittelyn diplomityöseminaari SGN-1980 sekä seminaariesitys SGN-1990 ovat pakolliset niille, jotka tekevät diplomityönsä tähän syventävään opintokokonaisuuteen.
| Opintojakso | Opintopisteet |
| MAT-41281 Tilastolliset monimuuttujamenetelmät | 6 op |
| SGN-1650 Signaalinkäsittelyn työkurssi | 5 op |
| SGN-6057 Introduction to Cell and Molecular Biology | 3 op |
| SGN-6106 Computational Systems Biology | 5 op |
| Yhteensä | 19 op |
Vaihtoehtoisista opintojaksoista on valittava vähintään viiden pisteen edestä opintojaksoja.
Valittava vähintään 5 pisteen edestä opintojaksoja
| Opintojakso | Opintopisteet |
| SGN-6166 Introduction to R programming | 3 op |
| SGN-6176 Microarray Data Analysis | 5 op |
| SGN-6186 Mathematical Modeling of Cellular Systems | 5 op |
| SGN-6236 Modeling Techniques for Stochastic Gene Regulatory Networks | 3 op |
| Yhteensä | 16 op |
Listasta täydennetään opintokokonaisuuden laajuuteen (30)
Systeemibiologia vaatii useiden eri alojen ammattilaisten saumatonta yhteistyötä. Systeemibiologian ydinalueita ovat molekyyli- ja solubiologia, biokemia, lääketiede, matematiikka, tilastotiede, signaalin- ja kuvankäsittely ja tietotekniikka. Näiden osa-alueiden osaamista vaaditaan kun pyritään mallintamaan monimutkaisia biologisia ilmiöitä järjestelmätasolla. Matemaattisten mallien tärkeys on korostunut biologisen mittausdatan määrän kasvaessa. Laskennallinen systeemibiologia pyrkii tarjoamaan työkalut tähän haastavaan ympäristöön. Laskennallisen systeemibiologian syventävät opinnot antavat teoreettisen pohjan ja käytännön taidot tarvittavien työkalujen suunnitteluun ja toteuttamiseen sekä systeemibiologisten ongelmien ratkaisemiseen. Opintokonaisuus antaa opiskelijalle valmiudet poikkitieteelliseen kanssakäymiseen systeemibiologian alalla. Opintokokonaisuus on osa Tietotekniikan koulutusohjelmaa, mutta muista koulutusohjelmista tulevat opiskelijat voivat osallistua siihen suorittamalla ensin vaadittavat esitiedot ja hankkimalla kohtalaisen ohjelmointitataidon erityisesti Matlab-ohjelmalla.