Histologian palvelut
Johdanto
Tampereen yliopiston histologian core-palvelu (”Histocore”) toivottaa käyttäjät tervetulleeksi tekemään histologista työtä nykyaikaisten laitteiden ja mikroskooppien avulla. Histologian tilat sijaitsevat Arvo-rakennuksen 3. kerroksessa (E-siipi, laboratoriot ja mikroskooppihuoneet, E318, E322-E326).
Histocorella on tilat ja välineet yleisimpien histologisten menetelmien tekemiseen. Tiloissa voi tehdä mm. kudosprosessoinnin, parafiini- ja kryoblokkien valmistuksen ja niiden leikkaamisen sekä solu- ja kudosrakenteiden visualisoimisen. Saatavilla on laaja valikoima histokemiallisia ja immunohistokemiallisia värjäys- ja detektiomenetelmiä, kudosten mikroarrayt ja spatiaalinen transkriptomiikka. Suuri osa laitteista on automatisoituja. Myös täysi palvelu on saatavilla tarvittaessa.
Digitaalisella mikroskooppilasien skannerilla voi lukea ja tallentaa näkymät koko objektilasin alueelta valomikroskooppisesti tai käyttäen laitteessa olevia fluoresenssikanavia. Histocore kannustaakin hyödyntämään virtuaalimikroskopiaa tuottamaan aineistoa kvantitatiivisia tieteellisiä analyysejä varten.
Kudosteknologiat:
Kudoksen preparointi
Histocorella on kolme kudosprosessoria kiinteiden kudosnäytteiden parafiinilblokkien valmistamiseen. Sekä formaliini- että Paxgene-fiksattuja kudoksia voidaan valmistaa.
Histocorella on kaksi liukuleikkaavaa mikrotomia ja yksi pyörömikrotomi parafiiniblokkien leikkaamiseen (leikkeen paksuutta voidaan säätää 2-6 mikrometriin). Jääleikkeiden leikkaamiseen on saatavilla Leica- ja Slee MEV+ -kryomikrotomit.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E325
Viljeltyjen solujen preparointi
Käyttäjät valmistavat itse kudospreparaatit. Soluviljelmät, jotka ovat suspensiossa, voidaan valmistaa leikattaviksi kudosblokeiksi käyttäen trombiinikoagulaatiotekniikkaa. Vaihtoehtoisesti voidaan käyttää Sakura Cytocentrifugea soluobjektilasien valmistamiseen IHC- ja IF-värjäystä varten.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E325
Kudosten värjäys
Histocorella on yksi Leica-värjäyslaite automaattiseen hematoksyliini-eosiini-värjäykseen ja muihin rutiinivärjäyksiin. Peitinlasi voidaan asettaa automaattisesti käyttäen DAKO-peitinlasinlaittajaa.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E324
Immunohistokemia
Histocorella on yksi Ventana BenchMark - ja kaksi LabVision -automaattivärjäyslaitetta automaattiseen immunohistokemiaan. Antigeenin saaminen esille voidaan tehdä PT-moduulilla, Retriever 2100:lla tai Biocarella tai mikroaaltouunilla käyttäen pH6- tai pH9-puskureita.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E324
Immunofluoresenssi
Immunofluoresenssivärjäys voidaan tehdä automaattisesti käyttäen LabVision Autostaineria (katso Immunohistokemiakappale yllä) tai manuaalisesti käyttäen erilaisia värjäystelineitä. Näistä JL-Stainer sopii hyvin 1-10 IF-lasin värjäykseen.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E324
Mikroarrayt kudoksista
Kudosmikroarrayden parafiiniblokkeja voidaan valmistaa käyttäen 3D Histech TMA Master -järjestelmää. Järjestelmä mahdollistaa 0,6-2 mm halkaisijaltaan olevien kudoslieriöiden stanssauksen ja keräämisen 1-2 TMA-blokkiin. TMA-blokkien leikkaus ja värjäys tehdään samoilla menetelmillä kuin perinteiset kudosnäytteet.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E325
Valomikroskoopit
Histocorella on useita Olympus BX- ja Leica DM -mikroskooppeja, joita käytetään objektilasien tarkasteluun. Osa näistä on varustettu digitaalisilla kameroilla kuvausta varten.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E324 ja E325
Fluoresenssimikroskooppi
Histocorella on Zeiss Axioplan -mikroskooppi monivärisen fluoresenssikuvantamisen ja kuvien tallennuksen mahdollistamiseksi. Mikroskooppi on varustettu ApoTome-laitteella, joka mahdollistaa strukturoidun valaistuksen avulla terävien konfokaalityyppisten kuvien tuottamisen eri tasoilla paksustakin kudoksesta kaikilla aallonpituuksilla. Mikroskooppia käytetään AxioVision-ohjelmiston avulla.
Laser capture -mikrodissektio
Veritas Arcturus Laser Capture -järjestelmää voidaan käyttää solusaarekkeiden tai yksittäisten solujen eristämiseen soluviljelmistä ja jäädytetyistä kudosleikkeistä. Mikrodissektoitu materiaali voidaan tutkia molekyylibiologian menetelmillä (esim. PCR-pohjaisilla menetelmillä).
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E332
GeoMx-järjestelmä
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E326
Virtuaalimikroskopia
Virtuaalimikroskopia tarkoittaa mikroskoopisten näytelasien digitoitujen versioiden taltiointia ja käsittelyä, jotka puolestaan tunnetaan yleisesti "virtuaalisina näytelaseina" tai "koko näytelasin kuvina (WSIs =whole-slide images)". Virtuaaliset näytelasit ovat koostekuvia, jotka koostuvat tuhansista korkearesoluutioisista digitaalisista mikrograafeista.
Virtuaalisten näytelasien skannausjärjestelmät
Histocorella on käytössä kaksi virtuaalisten näytelasien skanneria (Hamamatsu ja Olympus), jotka mahdollistavat usean mikroskooppilasin skannaamisen yhdessä erässä. Vaihtoehtoisesti myös 2×3 tuuman makronäytelasien skannaaminen on mahdollista. Käyttäjä voi valita skannaustarkkuuden 0,31 um/pikseli (10X objektiivilla) ja 0,16 um/pikseli (20X objektiivilla). Skannaus öljyimmersion objektiivien kanssa on myös mahdollista.
Molemmat skannerit mahdollistavat skannauksen epifluoresenssivalaistuksella käyttäen sinistä, vihreää ja punaista emissiospektriä. Skannauksen tulosteena käytetään jpeg2000-kuvamuotoa.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratorio E322 (Hamamatsu) ja E332 (Olympus)
Virtuaalimikroskopian skannausjärjestelmä kuoppalevyille
Kuoppalevyjä voidaan skannata järjestelmällä, joka on asennettu käänteismikroskoopin (Olympus IX71) tai EVOS FL Auto -laitteen yhteyteen. Nämä järjestelmät mahdollistavat solujen skannaamisen Petri-maljoilta ja 24-96 kuoppalevyiltä. Perusvalaistusjärjestelmänä käytetään faasikontrastia, mutta fluoresoiva valaistus (moottoroidulla suodattimen vaihtajalla) on myös mahdollista.
Sijainti: Arvo-rakennus, laboratoriot E332, E422 ja E462
Tampereen yliopiston histologian core-palvelu ("Histocore") on saatavilla MET:n tutkimusyhteisölle ja sopimuksen mukaan yhteistyökumppaneille ja sopimustutkimuksiin. Kysy lisää!
Henkilökuntamme antaman koulutuksen jälkeen käyttäjät voivat itse tehdä tiettyjä histologian laboratorion perustöitä. Näihin kuuluvat mikrotomien, kryomikrotomien, kudosprosessorien ja mikroskooppien käyttö ja parafiiniblokkien valu.
Erikoislaitteet ovat vain Histocoren henkilökunnan käytössä.
Teknikot auttavat sinua teknisissä kysymyksissä ja voivat tehdä kudosten käsittelyn, värjäyksen ja analysoinnin aina kun se on mahdollista.
Kysy meiltä palveluistamme, myös täysi palvelu on saatavilla!
Työpyyntölomake
Käytä alla olevaa lomaketta pyytääksesi palvelua Histocorelta:
Täytä lomake huolellisesti ja varmista, että kaikki tarvittavat tiedot on merkitty oikein. Epäselvät tai puutteelliset tiedot voivat viivästyttää näytteiden käsittelyä. Pyydä tarvittaessa apua Histocoren henkilökunnalta. Lähetä täytetty lomake sähköpostitse osoitteeseen histocore [at] tuni.fi (histocore(at)tuni.fi).
Huom! Itsepalvelussa ei tarvita työpyyntölomaketta, mutta käytettävän laitteen varaamista edellytetään (katso varausjärjestelmä alla).
Histocorella on rajoitetusti säilytystilaa. Pyydämme teitä noutamaan näytteet itse, kun työ on valmis, jos haluatte säilyttää ne.
Varausjärjestelmä
Kaikki käyttäjien itse käyttämät laitteet on varattava Agendon kautta.
Huomaa, että Histocoren henkilökunnalla on etusija laitteiden käytössä.
Hinnat
(vaatii kirjautumisen intraan)
Erityisprojekteissa kysy tarjousta!
Kiitokset
Kaikkien Tampereen yliopiston histologian core-palveluiden käyttäjien tulee kiittää sitä julkaisuissaan:
“Kirjoittajat kiittävät palveluistaan Tampereen yliopiston Histocore-palvelua".
Lisäksi pyydämme lisäämään Tampereen Histocore-palvelun julkaisun TUNICRIS-tallenteeseen kohtaan Tilat/laitteet.
Tampereen yliopiston histocore-palvelujen sähköpostiosoite: histocore [at] tuni.fi (histocore(at)tuni.fi)