Yhteiset jatkokoulutusopinnot koostuvat yliopiston tutkijakoulun ohjelmaan sisältyvistä opinnoista sekä yhteiskunta- ja kulttuuritieteiden yksikön yhteisestä seminaarista (ns. YKY-seminaarista). Näistä YKY-seminaari ja Tampereen yliopiston tutkijakoulun järjestämä tutkimusetiikan kurssi ovat pakollisia opintoja. Tutkimusetiikan kurssi suoritetaan siinäkin tapauksessa, että on suorittanut tutkimusetiikkaa filosofian aineopinnoissa. Muut yhteiset opinnot valitaan tutkijakoulun tai yksikön tohtoriohjelmien järjestämistä erityistieteiden menetelmäkursseista sekä tutkija- ja työelämätaitojen kursseista, ja niistä sovitaan ohjaajan kanssa.
YKY-seminaari, jossa esitellään omaa väitöskirjatyötä yksikön toisille tohtoriohjelmille, suoritetaan opintojen keskivaiheessa.