x !
Arkistoitu opetusohjelma 2015–2016
Selaat vanhentunutta opetusohjelmaa. Voimassa olevan opetusohjelman löydät täältä.
Bioteknologian maisteriopinnot
Näytä opetusohjelma tiivistelmänä

Periodit

I Periodi (31.8.2015 – 18.10.2015)
II Periodi (19.10.2015 – 20.12.2015)
III Periodi (11.1.2016 – 6.3.2016)
IV Periodi (7.3.2016 – 29.5.2016)

Vieraalla kielellä annettava opetus

BIO4230 Phylogenetics 4 ECTS
Juha Kesseli, Teacher responsible
juha.kesseli[ät]tuni.fi
Teaching
Independent work
Exam
Periods:
Language of instruction: English
Further information:

Book exam only. Available on the General Exam days of BMT.

BIO4240 Structural bioinformatics 3 - 6 ECTS
Periods:
Language of instruction: English
BIO4721 Introduction to Pattern Recognition and Machine Learning 5 ECTS

The course can be completed by one of the following courses:


SGN-13006: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-13006.html

TIETS39: https://www10.uta.fi/opas/opintojakso.htm?rid=11458&idx=3&uiLang=fi&lang=en&lvv=2015

Periods:
Language of instruction: English
Further information:

This course can be completed by several options based on availability. Please see both TUT and UTA websites for information on this course.

BIO4722 Machine Learning 5 ECTS

The course can be completed by one of the following courses:

SGN-42006:  http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-42006.html

TIETS07: https://www10.uta.fi/opas/opintojakso.htm?rid=11458&idx=0&uiLang=en&lang=en&lvv=2015

Periods:
Language of instruction: English
Further information:

This course can be completed by several options based on availability. Please see both TUT and UTA websites for information on this course.

BIO4708 SGN-41006 Signal Interpretation Methods 4 ECTS

For more information on this course, see the TUT website:

SGN-41006: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-41006.html

Periods:
Language of instruction: English
BIO4723 Data Structures and Algorithms 5 ECTS

This course can be completed by one of the following courses:


TIE-20106: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/kv/laitokset/Tietotekniikka/TIE-20106.html

TIETS01: https://www10.uta.fi/opas/opintojakso.htm?rid=11457&idx=2&uiLang=fi&lang=en&lvv=2016

Periods:
Language of instruction: English
Further information:

This course can be completed by several options based on availability. Please see both TUT and UTA websites for information on this course.



BIO4712 SGN-84007 Introduction to Matlab 1 ECTS

For more information on this course, see the TUT website: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-84007.html

Periods:
Language of instruction: English
BIO4715 TIE-02206 Basic Course on Programming 5 ECTS

For more information, please see the TUT course description:

TIE-02206: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/kv/laitokset/Tietotekniikka/TIE-02206.html

Periods:
Language of instruction: English
BIO4702 SGN-11006 Basic Course in Signal Processing 5 ECTS

For more information, please see TUT course catalogue:

SGN-11006: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-11006-1.html

Periods:
Language of instruction: English
Molekyylibiologian syventävät opinnot
BIO4661 Tilastollinen data-analyysi 3 - 5 op

Opintojakso suoritetaan käymällä jokin itseä kiinnostava tilastokurssi esim. HES:n (Regression models, Longitudinal data analysis tai HEAAC03 biostatistics), SIS:n tai TTY:n tarjonnasta.

Reija Autio, Vastaava opettaja
reija.autio[ät]tuni.fi
Periodit:
Opetuskieli: suomi
BTK4032 Tutkimusprojekti 8 op
Jarkko Valjakka, Vastaava opettaja
jarkko.valjakka[ät]tuni.fi
Opetus
Ryhmätyöskentely
Periodit:
Opetuskieli: suomi
Lisätiedot:

Opiskelija valitsee tutkimusalansa ja hakeutuu BioMediTech:n sisäiseen tai yksikön ulkopuoliseen tutkimusryhmään.

Valinnaiset opinnot
BTK4360 Tutkimusalan kirjatentti 6 op
Anne Kallioniemi, Vastaava opettaja
anne.kallioniemi[ät]tuni.fi
Periodit:
Opetuskieli: suomi
Lisätiedot:

Tentittävä aihealue ja materiaali sovitaan etukäteen vastuuopettjajan kanssa.

BTK4341 Kehitysbiologian perusteet 5 op
Periodit:
Opetuskieli: suomi
Lisätiedot:

Kurssia ei luennoida lukuvuonna 2015-2016, mutta se voidaan suorittaa kirjatenttinä. Tenttialueesta sovittava kurssista vastaavan opettajan kanssa.

Periodi (31.8.2015 - 18.10.2015)
Bioinformatiikan syventävät opinnot [I Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [I Periodi]

BIO2200 Introduction to computational biology 3 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Matti Nykter, Teacher responsible
matti.nykter[ät]tuni.fi
Teaching
2-Sep-2015 – 21-Oct-2015
Lectures 16 hours
Lectures
Wed 2-Sep-2015 - 14-Oct-2015 weekly at 9-11, Lecture hall FM1 (5th floor)
Exam
Fri 16-Oct-2015 at 9-12, FM1 5th floor and 3rd floor (if needed), Course exam.
Exercises 16 hours
Exercise group I
Mon 7-Sep-2015 - 12-Oct-2015 weekly at 10-12, Computer classroom ML74 (FM1, 5th floor), Weekly meetings.
Exercise group II
Tue 8-Sep-2015 - 13-Oct-2015 weekly at 9-11, Computer classroom ML74 (FM1, 5th floor), Weekly meetings
Exercise group III
Tue 8-Sep-2015 - 13-Oct-2015 weekly at 15-17, Computer classroom ML74 (FM1, 5th floor), Weekly meetings
Periods: I
Language of instruction: English
BIO4470 Systems biology methods 5 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Matti Nykter, Teacher responsible
matti.nykter[ät]tuni.fi
Juha Kesseli, Teacher responsible
juha.kesseli[ät]tuni.fi
Teaching
3-Sep-2015 – 22-Oct-2015
Lectures 24 hours
Lectures
Tue 1-Sep-2015 at 9-12, HISTO classroom (FM1, 5th floor), First lecture exceptionally on Tuesday.
Thu 10-Sep-2015 - 15-Oct-2015 weekly at 9-12, HISTO classroom (FM1, 5th floor), Weekly lectures on Thursdays.
Exam
Thu 22-Oct-2015 at 9-12, HISTO classroom (FM1, 5th floor)
Periods: I
Language of instruction: English
Further information:

Recommended during the second year of study in the bioinformatics programme. Prerequisites: BIO2200 Introduction to computational biology, BIO4440 Basic biological data analysis with R & BIO4450 High-throughput data analysis or equivalent prior knowledge in the field.

BIO4380 Bioinformatics Project 3 - 6 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Juha Kesseli, Teacher responsible
juha.kesseli[ät]uta.fi
Teaching
31-Aug-2015 – 29-May-2016
Independent work
Periods: I II III IV
Language of instruction: English
Further information:

Individual bioinformatics project as agreed with the teacher in charge.

BIO4395 Bioinformatics work course 5 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Ville Kytölä, Teacher responsible
Teaching
31-Aug-2015 – 20-Dec-2015
Independent work 135 hours Web-based
Periods: I II
Language of instruction: English
Further information:

Recommended during the second year of study in the bioinformatics programme. BIO4450 or equivalent knowledge is required  as a prerequisite.

BIO4460 Journal club 2 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Matti Nykter, Teacher responsible
matti.nykter[ät]tuni.fi
Teaching
7-Sep-2015 – 16-May-2016
Seminar 14 hours
Seminar
Seminars
Mon 7-Sep-2015 - 16-May-2016 every other week at 9-10, Lecture Hall FM1 (3rd Floor)
Periods: I II III IV
Language of instruction: English
Further information:

Seminar sessions on Monday mornings every second week as specified in the teaching schedule. Possible changes announced separately.

BIO4716 SGN-53007 Computational Diagnostics 5 ECTS

For more information on this course, see the TUT course description:

SGN-53007: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-53007.html

Periods: I
Language of instruction: English
BIO4704 SGN-52406 Models of Gene Networks 3 ECTS

For more information on this course, see the TUT course description:

SGN-52406: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-52406.html

Periods: I
Language of instruction: English
BIO4030 M.Sc. Thesis seminar 2 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Matti Nykter, Teacher responsible
matti.nykter[ät]tuni.fi
Teaching
31-Aug-2015 – 29-May-2016
Seminar 16 hours
Seminar
Wed 9-Sep-2015 - 11-May-2016 every other week at 14-16, FM1 red meeting room
Wed 18-May-2016 at 14.15-16.00, FM1, red meeting room
Periods: I II III IV
Language of instruction: English
Further information:

Seminar will be organized bi-weekly through out the academic year. Attendance to eight seminars, two presentations and active participation in discussion are required to pass the course. It is recommended to start attending the seminars already before you start your own Masters thesis project.

This seminar is organized jointly with BTK4030. More information can be found at Moodle, access code: BMT pro gradu

Molekyylibiologian syventävät opinnot [I Periodi]
BTK4030 Tutkielmaseminaari 2 op

Jokainen opiskelija pitää kaksi esitelmää, ensin tutkielmansa suunnitelmasta ja sitten saaduista tuloksista, sekä osallistuu aktiivisesti tieteellisen keskusteluun.

Kirjaston järjestämän "Systemaattisen tiedonhankinnan syventäminen" kurssin sisältönä on tieteellisen tiedonhankinnan prosessi, oman tieteenalan tiedonlähteiden tuntemuksen syventäminen ja tärkeimpien tiedonlähteiden päivitys.

Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Anne Kallioniemi, Vastaava opettaja
anne.kallioniemi[ät]tuni.fi
Opetus
9.9.2015 – 11.5.2016
Seminaari 16 tuntia
Seminaari
Ke 9.9.2015 - 16.12.2015 joka toinen viikko klo 14.15-16.00, punainen neukkari
Ke 20.1.2016 - 11.5.2016 joka toinen viikko klo 14.15-16.00, punainen neukkari
Ke 18.5.2016 klo 14.15-16.00, punainen neukkari
KIRJASTON OPETUS "Systemaattisen tiedonhankinnan syventäminen" ILMOITTAUTUMINEN JA ENNAKKOTEHTÄVÄ http://libguides.uta.fi/c.php?g=233275&p=1663982
Ma 5.10.2015 klo 9.15-11.45, Ryhmä 1, Tertio-kirjasto, ARVO
Ke 7.10.2015 klo 9.15-11.45, RYHMÄ 2, Tertio-kirjasto, ARVO
Ke 20.1.2016 klo 9.15-11.45, RYHMÄ 3, Tertio-kirjasto, ARVO
Luento-opetus
Periodit: I II III IV
Opetuskieli: suomi
Lisätiedot:

Seminaaritapaamisia järjestetään koko lukuvuoden ajan ja niihin voi tulla mukaan oman aikataulun mukaisesti. Osallistuminen suositellaan aloitettavaksi jo ennen oman pro gradu-projektin aloittamista. Opiskelijan on osallistuttava vähintään kahdeksaan seminaariin.

Kurssin Moodle alustalla on tarkempia ohjeita, avain: BMT pro gradu

Soluteknologian syventävät opinnot [I Periodi]
BTK4400 Kudosbiologia 6 op
Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Kati Juuti-Uusitalo, Vastaava opettaja
kati.juuti-uusitalo[ät]tuni.fi
Opetus
2.9.2015 – 18.9.2015
Luento-opetus 24 tuntia
Luento
Ke 2.9.2015 - 16.9.2015 viikoittain klo 8.15-11.00, FM1, 5. krs histoluokka
Pe 4.9.2015 - 18.9.2015 viikoittain klo 8.15-11.00, FM1, 5. krs histoluokka
Ma 7.9.2015 - 14.9.2015 viikoittain klo 8.15-11.00, FM1, 5. krs histoluokka
Kirjatentti 3 tuntia
Tentti
Ma 28.9.2015 klo 8.00-11.00, FM1, ls. 5. krs
Periodit: I
Opetuskieli: suomi

Vieraalla kielellä annettava opetus [I Periodi]

BTK4660 Cell Technology 4 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Kati Juuti-Uusitalo, Teacher responsible
kati.juuti-uusitalo[ät]uta.fi
Teaching
30-Sep-2015 – 9-Oct-2015
Lectures 15 hours
Luento
Wed 30-Sep-2015 - 7-Oct-2015 weekly at 8.15-11.00, FM1, 5. krs histoluokka
Fri 2-Oct-2015 - 9-Oct-2015 weekly at 8.15-11.00, FM1, 5. krs histoluokka
Mon 5-Oct-2015 at 8.15-11.00, FM1, 5. krs histoluokka
Exam 3 hours
Tentti
Fri 16-Oct-2015 at 8.00-11.00, FM1, ls. 5. krs
Periods: I
Language of instruction: English
Valinnaiset opinnot [I Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [I Periodi]

BIO2240 Molecular biology 5 - 9 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Kirsi Granberg, Teacher responsible
Teaching
31-Aug-2015 – 20-Dec-2015
Lectures
Lectures
Tue 8-Sep-2015 - 15-Dec-2015 weekly at 9-11, Histo Lecture Hall FM1 5th Floor
Lectures
Thu 10-Sep-2015 - 17-Dec-2015 weekly at 9-11, Histo Lecture Hall FM1 5th Floor
Periods: I II
Language of instruction: English
BIO2310 Mathematics and statistics for bioinformatics 4 - 8 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Juha Kesseli, Teacher responsible
juha.kesseli[ät]tuni.fi
Reija Autio, Teacher responsible
reija.autio[ät]tuni.fi
Teaching
1-Sep-2015 – 22-Dec-2015
Lectures 36 hours
Lectures
Tue 1-Sep-2015 at 12-15, Lecture Hall FM1 3rd Floor, Note! The first lecture of the course exceptionally on Tuesday.
Thu 10-Sep-2015 - 15-Oct-2015 weekly at 12-15, Lecture hall FM1, 3rd floor.
Thu 22-Oct-2015 - 17-Dec-2015 weekly at 12-15, Computer classroom ML74 (FM1, 5th floor)
Exercises 28 hours
Exercises
Fri 4-Sep-2015 - 16-Oct-2015 weekly at 10-12, FM1/ML74
Wed 21-Oct-2015 - 16-Dec-2015 weekly at 10-12, Computer class ML74 (FM1 5th Floor)
Periods: I II
Language of instruction: English
Further information:

Recommended time of study in the first year of the programme.

Note: since the course starts exeptionally on Tuesday 1.9 it formally ends on Tuesday 22.12, however last lecture is on Thursday 17.12.

BIO2350 Basics of programming and algorithms for bioinformatics 4 - 8 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Juha Kesseli, Teacher responsible
juha.kesseli[ät]tuni.fi
Teaching
2-Sep-2015 – 18-Dec-2015
Lectures 45 hours
Lectures
Wed 2-Sep-2015 - 16-Dec-2015 weekly at 12-15, Computer classroom ML74 (FM1, 5th floor), Weekly meetings.
Exceptions:
23-Sep-2015 at 12 –15 , FM1 lecture hall, 3rd floor (A+B), Note! Exceptional lecture place!
Exercises 30 hours
Exercises
Fri 4-Sep-2015 - 18-Dec-2015 weekly at 13-15, Computer classroom ML74 (FM1, 5th floor), Weekly meetings.
Exceptions:
18-Sep-2015 at 14 –16 , Computer classroom ML 74, FM1 (5th floor), Note! Exceptional practical time!
Periods: I II
Language of instruction: English
Further information:

Recommended for first year bioinformatics students.

Periodi (19.10.2015 - 20.12.2015)
Bioinformatiikan syventävät opinnot [II Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [II Periodi]

BIO2085 Bioinformatics tools (autumn 2015) 3 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Ville Kytölä, Teacher responsible
Teaching
19-Oct-2015 – 18-Dec-2015
Independent work 80 hours Web-based
Periods: II
Language of instruction: English
Further information:

Web-based course, no contact teaching. BIO2200 or equivalent knowledge is recommended as a prerequisite. Open for exchange students with suitable background. An identical course is organizaed in period IV.

BIO4707 SGN-53206 Cell Culturing, Microscopy and Cell Image Analysis 3 ECTS

For more information, please see the TUT course description:

SGN-53206: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-53206.html

Periods: II
Language of instruction: English
Molekyylibiologian syventävät opinnot [II Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [II Periodi]

BTK4300 Genes and Genomes 10 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Eric Dufour, Teacher responsible
eric.dufour[ät]tuni.fi
Teaching
16-Oct-2015 – 18-Dec-2015
Lectures
Luento
Fri 16-Oct-2015 - 27-Nov-2015 weekly at 9.15-12.00
Tutorials
Tutorial
Mon 19-Oct-2015 - 14-Dec-2015 weekly at 16.15-19.00
Wed 21-Oct-2015 - 9-Dec-2015 weekly at 16.15-19.00
Group work
Group work
Fri 4-Dec-2015 at 15.15-18.00
Periods: II
Language of instruction: English
Soluteknologian syventävät opinnot [II Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [II Periodi]

BTK4665 Embryology 4 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Heli Skottman, Teacher responsible
heli.skottman[ät]tuni.fi
Teaching
21-Oct-2015 – 17-Nov-2015
Lectures
Luento
Wed 21-Oct-2015 at 12.15-14.00, FM1, ls. 3. krs
Fri 23-Oct-2015 at 10.15-12.00, FM1, ls. 3. krs
Tue 27-Oct-2015 at 13.15-15.00, FM1, ls. 3. krs
Wed 28-Oct-2015 at 12.15-14.00, FM1, ls. 3. krs
Fri 30-Oct-2015 at 10.15-12.00, FM1, ls. 5. krs
Mon 2-Nov-2015 at 13.15-15.00, FM1, ls. 3. krs
Tue 3-Nov-2015 at 13.15-15.00, FM1, ls. 3. krs
Tue 17-Nov-2015 at 13.15-15.00, FM1, ls. 3. krs
Periods: II
Language of instruction: English
BTK4661 Cell Technology Laboratory Course 3 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Kati Juuti-Uusitalo, Teacher responsible
kati.juuti-uusitalo[ät]uta.fi
Teaching
16-Nov-2015 – 4-Dec-2015
Exercises 75 hours
Laboratoriotyö
Mon 16-Nov-2015 at 12.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Wed 18-Nov-2015 at 12.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Fri 20-Nov-2015 at 12.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Mon 23-Nov-2015 - 30-Nov-2015 weekly at 8.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Tue 24-Nov-2015 - 1-Dec-2015 weekly at 8.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Wed 25-Nov-2015 - 2-Dec-2015 weekly at 8.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Thu 26-Nov-2015 - 3-Dec-2015 weekly at 8.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Fri 27-Nov-2015 - 4-Dec-2015 weekly at 8.15-16.00, FM1, beta/gamma-laboratorio
Independent work 10 hours
Periods: II
Language of instruction: English
Valinnaiset opinnot [II Periodi]
BTK4463 ELT-73256 Biodegradable Polymers Laboratory Course 5 op
Niina Ahola, Vastaava opettaja
niina.ahola[ät]tut.fi
Opetus
Luento-opetus
Luento
Itsenäinen työskentely
Harjoitukset
Periodit: II III
Opintojakson kotisivu: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2014-2015/perus/laitokset/Elektroniikka_ja_tietoliikennetekniikka/ELT-73256.html
Opetuskieli: suomi

Vieraalla kielellä annettava opetus [II Periodi]

BTK4501 Advanced immunology 3 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Mataleena Parikka, Teacher responsible
mataleena.parikka[ät]tuni.fi
Teaching
10-Nov-2015 – 15-Dec-2015
Lectures
Labratoriotyöskentely
Wed 2-Dec-2015 at 12.00-14.30, FM1, alfa-laboratorio
Thu 3-Dec-2015 at 12.00-14.30, FM1, alfa-laboratorio
Fri 4-Dec-2015 at 12.00-13.00, FM1, alfa-laboratorio
Tue 8-Dec-2015 at 12.00-16.00, FM1, alfa-laboratorio klo 12-14, mikroskooppi klo 14-16
Harjoitustyö
Thu 10-Dec-2015 at 9.00-15.00, FM1, alfa-laboratorio
Tue 15-Dec-2015 at 12.00-15.00, FM1, alfa-laboratorio
Tulosten analysointi ja purku
Thu 17-Dec-2015 at 12.00-15.00, FM1, 5. krs, punainen neuvotteluhuone, Väittely klo 13-15
Luento
Tue 10-Nov-2015 - 17-Nov-2015 weekly at 10.15-12.00, FM1, 5. krs, punainen neuvotteluhuone
Thu 12-Nov-2015 - 19-Nov-2015 weekly at 10.15-12.00, FM1, 5. krs, punainen neuvotteluhuone
Mon 14-Dec-2015 at 12.15-15.00, Vierailuluento
Periods: II
Language of instruction: English
Further information:

The course will be taught next time in the autumn term 2017.

Periodi (11.1.2016 - 6.3.2016)
Bioinformatiikan syventävät opinnot [III Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [III Periodi]

BIO4440 Biological data analysis with R 5 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Juha Kesseli, Teacher responsible
juha.kesseli[ät]tuni.fi
Teaching
4-Jan-2016 – 31-Mar-2016
Lectures 28 hours
Lectures
Tue 12-Jan-2016 - 1-Mar-2016 weekly at 13-15, Lecture hall FM1 (3rd floor), Weekly meetings
Wed 13-Jan-2016 - 9-Mar-2016 weekly at 9-11, Lecture hall FM1 (3rd floor), Weekly meetings
Independent work 80 hours
Exercises 14 hours
Exercises
Fri 15-Jan-2016 - 11-Mar-2016 weekly at 14-16, Computer classroom ML74 (FM1, 5th floor), Weekly meetings
Periods: III
Language of instruction: English
Further information:

Recommended during the first year of study in the bioinformatics Master's degree programme. BIO2200 and BIO2310 or equivalent knowledge required as a prerequisite.

BIO4420 Programming and algorithms for bioinformatics 5 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Teaching
14-Jan-2016 – 19-Apr-2016
Lectures 32 hours
Lectures
Thu 14-Jan-2016 - 14-Apr-2016 weekly at 10-12, FM1/HISTO, Weekly meetings
Exercises 32 hours
Exercises
Wed 20-Jan-2016 - 20-Apr-2016 weekly at 14-16, Computer classroom ML74 FM1 (5th Floor), Weekly meetings
Wed 3-Feb-2016, Note! No class on 3rd February.
Periods: III IV
Language of instruction: English
BIO2450 Advanced bioinformatics tools 5 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Ville Kytölä, Teacher responsible
Teaching
4-Jan-2016 – 31-May-2016
Independent work 135 hours Web-based
Periods: III IV
Language of instruction: English
Further information:

The course is suitable for biotechnology students without prior programming experience. BIO2200 and BIO2085 or equivalent knowledge is recommended as a prerequisite.

Web-based course.

BIO4705 SGN-52606 Processing of Biosignals 5 ECTS

For more information, please see the course descrition on the TUT website:

SGN-52606: http://www.tut.fi/wwwoppaat/opas2015-2016/perus/laitokset/Signaalinkasittely/SGN-52606.html

Periods: III
Language of instruction: English
Molekyylibiologian syventävät opinnot [III Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [III Periodi]

BTK4311 Gene Expression 10 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Vesa Hytönen, Teacher responsible
vesa.hytonen[ät]tuni.fi
Teaching
13-Jan-2016 – 16-Mar-2016
Lectures
Luento
Wed 13-Jan-2016 - 16-Mar-2016 weekly at 11.15-14.00
Periods: III
Language of instruction: English
Valinnaiset opinnot [III Periodi]
BTK4320 Proteiiniteknologia 7 op
Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Vesa Hytönen, Vastaava opettaja
vesa.hytonen[ät]tuni.fi
Opetus
19.1.2016 – 23.2.2016
Luento-opetus
Luento
Ti 19.1.2016 - 23.2.2016 viikoittain klo 13.15-16.00
To 21.1.2016 - 18.2.2016 viikoittain klo 13.15-16.00
Periodit: III
Opetuskieli: suomi
Lisätiedot:

Opintojaksolle osallistuminen edellyttää riittäviä perustietoja. Perustiedot kuulustellaan verkossa Moodlealustalla opintojaksolle ilmoittauduttaessa.

BTK4090 Advanced microscopy 3 op
Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Teemu Ihalainen, Vastaava opettaja
teemu.ihalainen[ät]uta.fi
Opetus
9.3.2016 – 9.3.2016
Luento-opetus
Opetus
Ke 9.3.2016 - 4.5.2016 viikoittain klo 12.15-15.00
Periodit: III IV
Opetuskieli: suomi
BTK4663 In vitro models 4 op
Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Kati Juuti-Uusitalo, Vastaava opettaja
kati.juuti-uusitalo[ät]tuni.fi
Opetus
1.2.2016 – 12.2.2016
Harjoitukset
Laboratoriotyöskentely
Ma 1.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Ti 2.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Ke 3.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
To 4.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Pe 5.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Ma 8.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Ti 9.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Ke 10.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
To 11.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Pe 12.2.2016 klo 8.15-16.00, FM1, beta-laboratorio
Periodit: III
Opetuskieli: suomi
Periodi (7.3.2016 - 29.5.2016)
Bioinformatiikan syventävät opinnot [IV Periodi]

Vieraalla kielellä annettava opetus [IV Periodi]

BIO4450 High-throughput data analysis 5 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Juha Kesseli, Teacher responsible
juha.kesseli[ät]tuni.fi
Teaching
16-Mar-2016 – 20-May-2016
Lectures 28 hours
Lectures
Wed 16-Mar-2016 - 18-May-2016 weekly at 9-11, Histo Room FM1 (5rd Floor), Weekly meetings
Tue 22-Mar-2016 - 17-May-2016 weekly at 13-15, Histo Room FM1 (5rd Floor), Weekly meetings
Exercises 16 hours
Exercises
Fri 18-Mar-2016 - 20-May-2016 weekly at 14-16, Computer classroom ML74 FM1 (5th Floor), Weekly meetings
Independent work 80 hours
Periods: IV
Language of instruction: English
Further information:

BIO2200, BIO2310 and BIO4440 or equivalent knowledge required as a prerequisite.

BIO2085 Bioinformatics tools (spring 2016) 3 ECTS
Enrolment for University Studies
Enrolment time has expired
Ville Kytölä, Teacher responsible
Teaching
7-Mar-2016 – 20-May-2016
Independent work 80 hours Web-based
Periods: IV
Language of instruction: English
Further information:

Web-based course, no contact teaching. BIO2200 or equivalent knowledge is recommended as a prerequisite. Open for exchange students with suitable background. An identical course is organized in period II.

BTK1061 Basic concepts of genetics - Data analysis 2 ECTS

Students will perform typical genetics analysis tasks using commonly used computer programs. The module contains lectures that deepen the knowledge on genetics and introduce the analysis methods used.

Kirsi Granberg, Teacher responsible
kirsi.granberg[ät]uta.fi
Tommi Rantapero, Teacher responsible
Tommi.Rantapero[ät]uta.fi
Teaching
15-Mar-2016 – 19-May-2016
Exercises 10 hours
Genetics
Tue 26-Apr-2016 at 14.15-16.00, FM1, ls. 5. krs
Tue 10-May-2016 at 14.15-16.00, FM1, ls. 5. krs
Thu 12-May-2016 at 13.15-15.00, FM1, ls. 5. krs
Tue 17-May-2016 at 14.15-16.00, FM1, ls. 5. krs
Thu 19-May-2016 at 13.15-15.00, FM1, ls. 5. krs
Independent work 44 hours
Periods: IV
Language of instruction: English
Further information:

Recommended to be completed in parallel with BTK1061 lectures.

Soluteknologian syventävät opinnot [IV Periodi]
BTK4121 Farmakologisen biologian perusteet 4 op
Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Jarkko Valjakka, Vastaava opettaja
jarkko.valjakka[ät]tuni.fi
Opetus
3.3.2016 – 7.4.2016
Luento-opetus
Luento
Ti 8.3.2016 klo 12.15-14.00, FM1, histoluokka, Johdanto farmakologiaan
To 10.3.2016 klo 12.15-14.00, FM1, histoluokka, Reseptorit ja välittäjäaineet
Ti 15.3.2016 klo 16.15-18.00, FM1, histoluokka, Yleistoksikologia
Ke 16.3.2016 klo 12.15-14.00, FM1, histoluokka, Lääkeainesuunnittelun pohjatietoa
To 17.3.2016 klo 16.15-18.00, FM1, histoluokka, Imeytyminen ja jakautuminen
Ti 22.3.2016 klo 16.15-18.00, FM1, histoluokka, Elintoksikologia
Ke 30.3.2016 klo 12.15-14.00, FM1, histoluokka, Lin. regressio lääkeainesuunnittelussa, QSAR
To 31.3.2016 klo 16.15-18.00, FM1, histoluokka, Metabolia ja eritys
Ti 5.4.2016 klo 12.15-14.00, FM1, histoluokka, 3D lääkeainesuunnittelussa, CoMFA
Ke 6.4.2016 klo 12.15-14.00, FM1, histoluokka, Ideasta->keksintöön->tuotteeksi
To 7.4.2016 klo 12.15-14.00, FM1, histoluokka, Oman mallituksen pohjustaminen
Su 17.4.2016, Klo 23.59 Moodle, Kotikokeen palautus
Alkukuulustelu
To 3.3.2016 klo 16.15-16.45, Moodlessa
Periodit: IV
Opetuskieli: suomi
Lisätiedot:

Esitietoina kuulustellaan Moodle oppimisalustalla kirjan Pelkonen & Ruskoaho, Lääketieteellinen farmakologia ja toksikologia osiot: Yleisfarmakologia ja –toksikologia, Farmakologia ja toksikologia, Farmakologian merkitys lääketieteessä, Farmakodynamiikka, Farmakokinetiikka, Lääkeaineiden kehittäminen, Autonomisen hermoston farmakologiaa, Keskushermoston välittäjäaineet ja reseptorit, Paikalliset välittäjäaineet ja Toksikologian käsitteet ja mekanismit.

Valinnaiset opinnot [IV Periodi]
BTK4410 Cancer Biology 4 op
Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Anne Kallioniemi, Vastaava opettaja
anne.kallioniemi[ät]tuni.fi
Opetus
7.3.2016 – 9.5.2016
Luento-opetus 15 tuntia
Lectures
Ma 21.3.2016 - 25.4.2016 viikoittain klo 12.15-15.00, FM1, ls. 3. krs, No lecture on 28.3.
Exam
Ma 16.5.2016 klo 12.15-15.00, FM1, ls. 3. krs
Seminaari 6 tuntia
Seminar
Ma 2.5.2016 - 9.5.2016 viikoittain klo 12.15-15.00, FM1, 3. krs. ls
Periodit: IV
Opetuskieli: suomi
BTK4322 Proteiiniteknologian työt B 7 op
Tutkinto-opiskelijoiden ilmoittautuminen
Ilmoittautuminen Nettiopsussa on päättynyt
Vesa Hytönen, Vastaava opettaja
vesa.hytonen[ät]tuni.fi
Opetus
9.5.2016 – 20.5.2016
Harjoitukset
Laboratoriotyöskentely
Ma 9.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Ti 10.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Ke 11.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
To 12.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Pe 13.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Ma 16.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Ti 17.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Ke 18.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
To 19.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Pe 20.5.2016 klo 8.15-16.00, FM1, gamma-laboratorio
Periodit: IV
Opetuskieli: suomi
BioMediTech
Tenttiminen