Hyppää pääsisältöön
Mass Spectrometry Facility

Massaspektrometriapalvelu

Tampereen yliopisto
Kaupin kampus
OsoiteArvo Ylpön katu 34, 33520 Tampere
 
Palveluhaku
 
Tutkimushaku
Tilat ovat esteettömätTilat ovat esteettömät
Mass Spectrometry Facility

Core lopettaa toiminnan vuoden 2023 lopussa

Johdanto

NanoLC-MSTOF-nestekromatografia-massaspektrometria on analyyttinen tekniikka, joka ensin erottelee yhdisteet niiden kemiallisten ominaisuuksien perusteella gradienttivirran avulla ja sen jälkeen ionisoi kemialliset yhdisteet ja tunnistaa ne massa-varaussuhteen sekä fragmentaatiokuvioiden perusteella.

Palvelumme on erikoistunut proteiinien suhteelliseen kvantifiointiin ilman merkkiaineita pienistä kliinisistä näytteistä käyttäen SWATH-MS-menetelmää. Yksiköllämme on laaja proteomiikkaosaaminen ja tarjoamme analyysipalveluja pieniin ja suuriin tutkimuksiin, mukaan lukien perusproteiinien tunnistamistutkimukset sekä kliiniset kokeet/löytämistutkimukset. Tarvittaessa yksikkö voi tarjota täyden palvelun näytteiden valmistelusta, analyysista ja bioinformatiikasta.

Tyypillinen proteiinien löytämistutkimus sisältää kirjaston luomisen suhteelliseen SWATH-MS kvantifikaatioon, näytteiden valmistelun, SWATH-MS-analyysin, tulosten suhteellisen kvantifikaation ja bioinformatiikan. Tyypillisessä tutkimuksessa, jossa käytetään kudosnäytteitä tai solun lysaatteja suhteellisen yksinkertaisella näytteenkäsittelyllä, saadaan 3000-4000 suhteellisesti kvantifioitua proteiinia per näyte.

Mahdollisia näytteitä voivat olla esimerkiksi:

  • Kehon nesteet (kyynelneste, veri, plasma, virtsa jne.)
  • Kudos (tuore tai parafiiniin valettu)
  • Solulysaatti
  • Soluviljelyliuos
  • Ekstrasellulaarivesikkelit
  • Pull-down-seokset
  • Proteiinijuova SDS-PAGE-geelistä

Olemme luoneet useita kvantifikaatiokirjastoja. Kysy, onko meillä on jo kirjasto, joka sopii tarpeisiisi.

Täytä kyselylomake (pdf englanniksi), jotta voimme keskustelella tarpeistasi tarkemmin:

KIITOKSET

Kaikkien Massaspektrometriapalvelua käyttävien käyttäjien on velvollisuus mainita julkaisuissaan:

"Kirjoittajat kiittävät palveluistaan Tampereen Massaspektrometriapalvelua."  tai

“The authors acknowledge the Tampere Mass Spectrometry Facility for their service.”