Tausta
Syövän seulontaohjelmat hyödyntävät yhä enemmän laajoja pitkittäisiä terveystietoaineistoja, kuten biomarkkereita, kuvantamistietoa ja potilaiden seurantatietoja. Nykyiset tilastolliset mallit kuvaavat sairauden etenemistä, mutta eivät usein huomioi riittävästi sairauden vaiheen ja biomarkkereiden kehityksen välistä kaksisuuntaista yhteyttä. Tämä voi heikentää riskien ennustamista ja seulontapäätösten tarkkuutta. Hanke perustuu suomalaiseen ProScreen-eturauhassyövän seulontatutkimukseen, joka on yksi maailman suurimmista MRI-kuvantamista hyödyntävistä seulontatutkimuksista.
Tavoite ja tehtävät
MarkovForScreening-hankkeen tavoitteena on kehittää uuden sukupolven tulkittavia tilastollisia ja koneoppimiseen perustuvia menetelmiä, joita kutsutaan kaksisuuntaisiksi monivaiheisiksi Markovin malleiksi (Bidirectional Multistate Markov Models, Bi-MMM). Menetelmät yhdistävät sairauden etenemisen ja biomarkkereiden muutosten mallintamisen paremman yksilöllisen riskiennusteen, seulontastrategioiden ja päätöksenteon tueksi. Hanke yhdistää biostatistiikkaa, koneoppimista, Bayes-päättelyä ja geometrista data-analyysiä.
Vaikuttavuus
Hanke tuottaa terveydenhuollon ammattilaisille, päättäjille ja kansalaisille luotettavampaa tietoa syöpäseulontojen hyödyistä ja haitoista. Tarkemmat ennusteet voivat vähentää tarpeettomia tutkimuksia ja hoitoja sekä tukea yksilöllisempää ja kustannusvaikuttavampaa terveydenhuoltoa. Kehitettävät avoimen lähdekoodin menetelmät soveltuvat myös muiden sairauksien, kuten rintasyövän ja diabeteksen, tutkimukseen ja tukevat eurooppalaista terveystieteellistä tutkimusta sekä yksilöllistetyn lääketieteen kehitystä
Tutkimusrahoitus
Partnerit
Jaakko Nevalainen, Tampere university,
Anssi Auvinen, Tampere university
Cécile Proust-Lima, Bordeaux university, Bordeaux Population Health research center
Yhteyshenkilöt
Samuel Gruffaz (PI)
samuel.gruffaz [at] tuni.fi