|
|
|||||||||||||||||
Opinto-opas 2010-2011
Laskennallinen systeemibiologia, 30 op |
Opintokokonaisuuden tyyppi
Syventävät opinnot
Yhteyshenkilö
Reija Autio, Olli Yli-Harja
Osaamistavoitteet
| - | Opintokokonaisuuden tavoitteena on tarjota opiskelijalle biologisen datan, signaalien ja kuvien analyysin sekä mallinnuksen teoreettiset perustiedot ja käytännön taidot yksinkertaisten systeemibiologisten ongelmien ratkaisemiseen. |
| - | Opintokokonaisuuden suoritettuaan opiskelija osaa: |
| - | - Kehittää laskennallisen systeemibiologian menetelmiä |
| - | - Raportoida laskennallisen systeemibiologian eri alueiden uusimmista tutkimuksista |
| - | - Vertailla ja valita sopiva menetelmä tiettyyn laskennallisen systeemibiologian ongelmaan |
| - | - Tulkita ja kirjoittaa alan tieteellistä tekstiä. |
Esitietovaatimukset
| Opintokokonaisuus | Opintopisteet | P/S | Lisätiedot |
| 25 op | Suositeltava | ||
| 25 op | Suositeltava | Esitiedoiksi käy molemmat kokonaisuudet Laskennallinen systeemibiologia ja Laskennallinen systeemibiologia(B) | |
| 25 op | Suositeltava | ||
| 25 op | Suositeltava | ||
| 25 op | Suositeltava | ||
| 25 op | Suositeltava | ||
| 25 op | Suositeltava |
Esitietoina tulee olla myös suoritettuna kurssit SGN-1200 Signaalinkäsittelyn menetelmät ja SGN-2500 Johdatus hahmontunnistukseen ( Suositeltava )
Sisältö
Pakolliset opintojaksot
Signaalinkäsittelyn diplomityöseminaari SGN-1980 sekä seminaariesitys SGN-1990 ovat pakolliset niille, jotka tekevät diplomityönsä tähän syventävään opintokokonaisuuteen.
| Opintojakso | Opintopisteet | Vaihtoehtoisuus |
| SGN-1706 Signal Processing Project | 5-8 op | |
| SGN-1980 Signaalinkäsittelyn diplomityöseminaari | 1 op | |
| SGN-1990 Signaalinkäsittelyn diplomityöseminaariesitys | 0 op | |
| SGN-6058 Introduction to Biology of the Cell | 3 op | 1 |
| SGN-6106 Computational Systems Biology | 5 op | |
| YHTTAY-1010 Solun biologia | 7 op | 1 |
| Yhteensä | 21 op |
1. Kursseista YHTTAY-1010 tai SGN-6058 on suoritettava vähintään toinen, ellei niistä jompi kumpi sisälly jo perus- tai aineopintoihin. Kurssi SGN-6106 on pakollinen, ellei se sisälly jo perus- tai aineopintoihin.
Vaihtoehtoiset opintojaksot
Mikäli opiskelija on suorittanut osan vaihtoehtoisista kursseista jo laskennallisen systeemibiologian aineopintokokonaisuuteen, täytyy hänen suorittaa muita vaihtoehtoisia opintojaksoja 10 opintopisteen edestä.
Valittava vähintään 10 pisteen edestä opintojaksoja
Täydentävät opintojaksot
Kaikkia vaihtoehtoisia opintojaksoja voi myös käyttää täydentämään opintokokonaisuuden kokonaislaajuuteen. Listassa olevien kurssien lisäksi Tampereen yliopiston tarjoamia kursseja BIKE2080 Bioinformatiikka, BIOI2080 Introduction to bioinformatics, BIOI4240 structural bioinformatics, BIOI4210 bioinformatics in functional genomics ja BIOI4230 Phylogenetics voidaan käyttää täydentävinä opintojaksoina. Muiden kuin biotekniikan koulutusohjelman opiskelijoiden on anottava Tampereen yliopiston tarjoamiin kursseihin JOO-opinto-oikeus.
Listasta täydennetään opintokokonaisuuden laajuuteen (30)
Lisätiedot
Laskennallinen systeemibiologia vaatii useiden eri alojen ammattilaisten saumatonta yhteistyötä. Laskennallisen systeemibiologian ydinalueita ovat molekyyli- ja solubiologia, biokemia, lääketiede, matematiikka, tilastotiede, signaalin- ja kuvankäsittely ja tietotekniikka. Näiden osa-alueiden osaamista vaaditaan kun pyritään matemaattisesti monimutkaisia biologisia ilmiöitä järjestelmätasolla. Matemaattisten mallien ja algoritmien kehittämisen tärkeys on korostunut biologisen mittausdatan määrän kasvaessa. Laskennallinen systeemibiologia pyrkii tarjoamaan työkalut tähän haastavaan ympäristöön. Laskennallisen systeemibiologian syventävät opinnot antavat teoreettisen pohjan ja käytännön taidot tarvittavien työkalujen suunnitteluun ja toteuttamiseen sekä systeemibiologisten ongelmien ratkaisemiseen. Opintokonaisuus antaa opiskelijalle valmiudet poikkitieteelliseen kanssakäymiseen systeemibiologian alalla.